Matthijs Lunenburg arbeitet seit 2012 am Mozarteum, wo er Cornett als Wahlfach unterrichtet und die Blockflötistin Dorothee Oberlinger assistiert. Er hat mehrere Forschungsprojekte zu improvisierten Verzierungen (Ornamentik) durchgeführt und interessiert sich derzeit vor allem für die Musik des 16. und 17. Jahrhunderts.
Er studierte Blockflöte am Conservatorium van Amsterdam und Zink bei William Dongois in Paris und Genf. Als Blockflötist trat er in Europa und den USA mit Ensembles wie der Royal Wind Music (2003–2010) und dem portugiesischen Blockflötenensemble A Imagem de Melancholia auf. Als Zinkist trat er unter anderem mit dem Freiburger Barockorchester, der Lautten Compagney, der Capella de la Torre, dem Balthasar Neumann Ensemble, dem Marini Consort, der Capella Confluentes und Musica Antiqua Salzburg auf.